丽江市位于北纬25°59′－27°56′，东经99°23′－101°31′是云南省西北部云贵高原与青藏高原的连接部位。北连迪庆藏族自治州，南接大理白族自治州，西邻怒江傈僳族自治州，东与四川凉山彝族自治州和攀枝花市接壤，距省会昆明市580公里，高等级公路、铁路和机场与市外相连，交通及通信均较为便利。国土面积2.06万平方公里，全市属低纬度暖温带高原山地季风气候，由于海拔高差较大（1015–5596米），导致多种气候类型并存，属典型的立体气候，全年平均气温在12.6–19.9℃之间；全年无霜期为191–310天，年均降雨量为910–1040毫米，年日照时数在2321–2554小时。全市共辖永胜、玉龙、宁蒗、华坪县及古城区，全市总人口118万人，其中农业人口有97万人，农民人均纯收入低于全省，全市工业经济不发达，山区农民种植业结构较单一，产值较低，贫困面大，贫困程度深，山区农业经济发展直接影响全市农村经济的全面、持续、健康发展。全市共有耕地面积149.15万亩，山区耕地面积大（占全市耕地面积的36.3％），分布广，地形地貌复杂，立体气候明显，生态环境优良，具有种植小杂粮的悠久历史，很适宜发展特色小杂粮产业。目前我市较有特色和优势的小杂粮主要有芸豆（多花菜豆）、荞麦（苦荞）、蚕豆。根据全市杂粮生产情况及特色，初步确定玉龙县为芸豆生产优势基地县，宁蒗县为荞麦生产优势基地县，永胜县为蚕豆生产优势基地县。
全市种植苦荞面积约12万亩，其中以宁蒗县为主，面积约8万亩，常年平均亩产为95公斤左右。2009年国家苦荞区试及生产试验点设在宁蒗县跑马坪乡，试验规范，各品系长势良好。
全市种植芸豆（多花菜豆）面积约10万亩，主要以玉龙县（5万亩）和宁蒗县（3万亩）为主。主要品种有丽江大白芸豆、丽江大黑花芸豆、日本大正金时豆等。平均单产约110公斤，其中玉龙县的鲁甸乡、黎明乡、太安乡具有优越的气候条件和无污染的生态条件，已通过了美国NOP认证，德国BCS认证及日本JAS认证，十分适宜芸豆产业的开发，可以以有机芸豆出口到国外。目前，玉龙县的芸豆栽培达到种植技术科学化，品种优良化，种植规范化，管理标准化，品质国际化。
丽江市农业科学研究所为全市主要农业科研机构现有在职职工38人，其中专业技术人员30人，高职12 人（正高1人），中职8人；硕士研究生3人，本科11人，专科5 人，。全所设有水稻研究推广室、旱粮作物研究推广室、经济作物研究推广室、马铃薯组培快繁中心、太安山区农业综合示范场、涛源水稻超高产栽培研究示范场和办公室等七个部门。自“八五”以来，自主育成农作物新品种11个（马铃薯4个，水稻4个，小麦3个），获得科技成果奖52项，其中省部级16项，市厅级34项，县级2项。全所有农业科技创新和新品种、新技术展示示范基地，300余亩，水电路配套，有各类房屋建筑3800多平方米，其中实验室近900平方米，组织培养室400多平方米，各类仪器设备270多万元，有各类钢架联体大棚12000平方米。
多年来，丽江市农科所以增强农业科技创新能力，促进农业增效，农民增收为宗旨，实施农作物新品种、新技术研究开发及示范推广，加速科研成果的转化应用，在云南最具特色和竞争力的马铃薯新品种选育、脱毒种薯生产、高寒水稻育种以及水稻超高产研究为重点，在全市农业发展中努力发挥科技先导和示范服务作用。“十五”以来，先后实施了农业部“滇西北马铃薯脱毒原原种扩繁基地建设”、“丽江市优质常规水稻良种繁育基地建设” 、“丽江市优质芸豆良种繁育基地建设”，云南省农业厅与国际马铃薯中心合作的“马铃薯杂交实生籽应用技术研究示范”等重大科技项目10多项，多年承担国家杂粮（苦荞）区试及生产试验示范推广工作。